Lilo Setup instaluje nowy bootloadera LILO na komputerze.

Bootloader jest zobowiązany do uruchomienia głównego systemu operacyjnego komputera, i wyświetla początkowe menu startowe, jeśli kilka systemów operacyjnych dostępnych jest na tym samym komputerze.

Konieczne jest (re)konfiguracja bootloadera za każdym razem po zainstalowaniu nowego systemu operacyjnego na komputerze.

Konfiguracja Lilo może być również przydatna w procesie odzyskiwania danych, w takim przypadku konieczne może być uruchomienie go z Live CD, jeśli zostały utracone wszystkie inne środki na uruchomienie systemu.